Publikationen Dr. J. Müller (Auswahl)
Publikationen der Arbeitsgruppe (Auswahl)
Grafahrend-Belau, E., Junker A., Eschenröder, A., Müller, J., Schreiber, F, Junker, B.H. (2013): Multiscale Metabolic Modeling: Dynamic Flux Balance Analysis on a Whole-Plant Scale. doi: http://dx.doi.org/10.1104/pp.113.224006; Plant Physiology 163: 637-647.
Bastet J., Müller J., Christen O. (2013): LEAFC3-N: modeling effects of drought stress on photosynthesis, stomatal conductance and transpiration. 7th International Conference on Functional–Structural Plant Models, 9-14th June 2013, Saariselkä, Finland.
Müller J., Eschenröder A., Christen O. (2013): Towards integrating primary C-N metabolism and physiology of crop growth across different plant scales: the ProNet-CN model – a multiscale approach for functional-structural plant modeling. 7th International Conference on Functional–Structural Plant Models, 9-14th June 2013, Saariselkä, Finland.
Müller J, Eschenröder A, Christen O., Junker B., Schreiber F. (2012): ProNet-CN Model: A Dynamic and Multi-Scale Process Network Combining Photosynthesis, Primary Carbon Metabolism and Effects of Leaf Nitrogen Status. In: Kang M., Dumont Y., Guo Y. (eds.): 2012 IEEE 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications. Shanghai, China. 31st. Oct. – 3rd Nov. 2012, 289-296.
Müller J., Eschenröder A. (2010): LEAFC3-N – a Nitrogen and Drought Sensitive Model Coupling CO2, H2O and Radiative Fluxes: Overview, Improved Program Code, and Prospects. 11th ESA congress Montpellier, 29-03.09. 2010, Ref 236.
Müller J., Eschenröder A. (2010): CO2, H2O and energy exchange model LEAFC3-N: Drought stress effects, optimized solution algorithms, functionality tests. In: DeJong, Th,, Da Silva, D. (eds.), Proceedings of the 6th International Workshop on Functional-Structural Plant Models. September 12-17, 2010. University of California, Davis, 168-170.
Müller, J., Eschenröder, A., Ghaffari, M. R., Hajirezaei, M. R., Herter, T., Junker, A., Junker, B., Leps, M., Lotz, K., Usadel, B., Schreiber F. (2010): Multiscale Metabolic Modeling (MMM) of biomass formation: An integrative systems biology approach that needs to be linked with models of plant architecture. In: DeJong, Th,, Da Solva, D. (eds.), Proceedings of the 6th International Workshop on Functional-Structural Plant Models. September 12-17, 2010, University of California, Davis, 240-242.
Müller, J., Eschenröder, A., Ghaffari, M. R., Hajirezaei, M. R., Herter, T., Junker, A., Junker, B., Leps, M., Lotz, K., Usadel, B., Schreiber F. (2010): Multiscale Metabolic Modelling (MMM): An integrative crop systems biology approach. 11th ESA congress Montpellier, 29-03.09. 2010, Ref 222.
Lemke, R., Hajirezaei, M., Junker, B. H., Müller, J., Usadel, B., Wünschiers R., Schreiber, F. (2009): Mehrskalen-Stoffwechselmodelle von Getreiden: Ein integrativer systembiologischer Ansatz für die Biomasseforschung (Multiscale Metabolic Modelling of cereals: an integrative systems biology approach for biomass research), Genomexpress 4.09: 16-18.
Braune, H., Müller, J., Diepenbrock, W. 2009: Integrating effects of leaf nitrogen, age, rank, and growth temperature into the photosynthesis-stomatal conductance model LEAFC3-N parameterised for barley (Hordeum vulgare L.). Ecol. Mod. 220, 1599–1612.
Müller, J. 2009: LEAFC3N: Ein Stickstoff-sensitives Modell der gekoppelten Prozesse der CO2-Assimilation und Transpiration. In: Kage, H., Kersebaum, K. C., Müller, T. (Eds): Modellierung des Systems Nutzpflanze-Boden – Herausforderungen des 21. Jahrhunderts. Berichte der Gesellschaft für Pflanzenbauwissenschaften Bd. 4 2009, 115-119.
Müller, J., Braune, H., Diepenbrock, W. 2009: Complete parameterisation of photosynthesis models – an example for barley. In: Cao, W., White, J. W., Wang, E. (Eds.): Crop Modeling and Decision Support. Springer/Tsinghua University Press, 12-23.
Müller, J., Eschenröder, A., Diepenbrock, W. 2009: Through-flow chamber CO2/H2O canopy gas exchange system-Construction, microclimate, errors, and measurements in a barley (Hordeum vulgare L.) field. Agricultural and Forest Meteorology 149, 214-229.
Müller, J., Braune, H., Diepenbrock, W. 2008: Photosynthesis - stomatal conductance model LEAFC3-N: specification for barley, generalised nitrogen relations and aspects of model application. Functional Plant Biology (Special Issue Functional-Structural Plant Modelling) 35, 797-810.
Müller, J., Braune, H., Diepenbrock, W. 2008: Accounting for the plasticity of photosynthetic processes by the photosynthesis model LEAFC3-N. Mitt. Ges. Pflanzenbauwissenschaften und Vorträge für Pflanzenzüchter, 17-18.
Müller, J., Braune, H., Diepenbrock, W. (2008d): Accounting for the plasticity of photosynthetic processes by the photosynthesis model LEAFC3-N. Mitt. Ges. Pflanzenbauwissenschaften und Vorträge für Pflanzenzüchter, im Druck.
Behrens, T., Müller, J., Diepenbrock, W. (2007): Optimizing a diode array VIS/NIR spectrometer system to detect plant stress in the field. Journal of Agronomy and Crop Science 193: 292-304.
Braune, H., Müller, J., Diepenbrock, W. (2007): Measurement and modelling of awn photosynthesis of barley (Hordeum vulgare L.) for Virtual Crop Models. Pflanzenbauwissenschaften (German Journal of Agronomy and Crop Science) 11: 10-15.
Büker, P., Emberson, L. D., Ashmore, M. R., Cambridge, H. M., Jacobs, C. M. J., Massman, W., J., Müller, J., Nikolov, N., Novak, K., Oksanen, E., Schaub, M., de la Torre, D. (2007): Comparison of different stomatal conductance algorithms for ozone flux modelling. Environmental Pollution 146: 726-735.
Müller, J. (2007): Wirkung von Trockenstress und erhöhter CO2-Konzentration – Ökophysiologische Reaktionsmuster unterschiedlicher Stoff- und Ertragsbildungstypen von Winterwiezen und Triticale. Wirkung von Trockenstress und erhöhter CO2-Konzentration – Ökophysiologische Reaktionsmuster unterschiedlicher Stoff- und Ertragsbildungstypen von Winterweizen und Triticale. In: Förster, K., Balko, C., Friedt, W. (Hrsg.): Klimawandel als Herausforderung - Entwicklung und Nutzung stresstoleranter Sorten für Nahrung und Energie. Gemeinsame Vortragstagung Gesellschaft für Pflanzenzüchtung und Gesellschaft für Pflanzenbauwissenschaften, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Halle/Saale, 4.-5. Oktober 2007, 105-117.
Müller, J., Braune, H., Diepenbrock, W. (2007): Ein generisches Photosynthese- und Transpirationsmodul für die Modellierung der Stoffbildung von Weizen, Gerste und Raps auf Organ- und Bestandesebene. In: Böttinger, S., Theusen, L., Rank, S., Morgenstern, M. (Hrsg.): Agrarinformatik im Spannungsfeld zwischen Regionalisierung und globalen Wertschöpfungsketten. Referate der 27. GIL-Jahrestagung, 5.-7. März 2007, Stuttgart. Gesellschaft für Informatik, Köllen Druck+Verlag GmbH Bonn, 151-154.
Müller, J., Braune, H., Wernecke, P., Diepenbrock, W. (2007): Towards universality and modularity: A generic photosynthesis and transpiration modul for functional structural plant models. Proc. 5th International Workshop on Functional Structural Plant Models, Napier, New Zeeland, Nov. 4-9, 2007, http://algorithmicbotany.org/FSPM07/program.html
Müller, J., Wernecke, P., Braune, H., Diepenbrock, W. (2007): Photosynthesis and carbon balance. In: Vos, J., Marcelis, L.F.M., de Visser, P.H.B., Struik, P.C., Evers, J.B. (Eds.): Functional-Structural Plant Modelling in Crop Production. Wageningen UR Frontis Series v. 22, Springer, Dordrecht, The Netherlands, 91-101.
Wernecke, P.; Dornbusch T., Müller J. (2007): A dynamic model system to couple the organ length and mass dynamics specified for spring barley (Hordeum vulgare L.). Proc. 5th International Workshop on Functional Structural Plant Models, Napier, New Zeeland, Nov. 4-9, 2007, http://algorithmicbotany.org/FSPM07/program.html.
Wernecke, P., Müller, J., Dornbusch, T., Diepenbrock, W. (2007): The virtual crop modelling system VICA specified for barley. In: Vos, J., Marcelis, L.F.M., de Visser, P.H.B., Struik, P.C., Evers, J.B. (Eds.): Functional-Structural Plant Modelling in Crop Production. Wageningen UR Frontis Series v. 22, Springer, Dordrecht, The Netherlands, 53-64.
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Müller, J., Behrens, T., Diepenbrock, W. (2006): Measurement and modelling of organ- and canopy-scale gas exchange of oilseed rape. IX ESA Congress, 4 – 7. Sept. 2006, Warszawa, Poland. Proceedings. Biblicotheka Fragmenta Agronomica 11: 317-318.
Müller, J., Behrens, T., Diepenbrock, W. (2006): Modellgestützte Bestimmung von Organflächenindizes aus dem Bestandesflächenindex bei Raps. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 18: 164-165.
Müller, J., Wernecke, P., Braune, H. , Diepenbrock W. (2006): Virtual Crop Model – Barley: Kopplung von Pflanzenarchitektur, Strahlungsinterzeption und Stoffbildung. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 18: 290-291.
Müller, J., Wernecke, P., Dornbusch, T., Braune, H., Diepenbrock W. (2006): Models as a tool for analysing complex plant systems. The example – rapeseed biomass formation. Jahrestagung Ges. Pflanzenernährung, Poster.
Müller, J., Diepenbrock W. (2006): Measurement and modelling of canopy gas exchange of leaves and pods of oilseed rape. Agricultural and Forest Meteorology 139: 307-322.
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Wernecke, P., Müller, J., Dornbusch, T., Wernecke, A., Diepenbrock W. (2006): VICA – Barley: 3D Simulation eines Pflanzenbestandes (Architektur, C-Input, Stoffbildung und –verteilung). Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 18: 292-293.
Müller, J., Behrens, T., Diepenbrock, W. (2005): Measurement and modelling of canopy gas exchange of winter oilseed rape (Brassica napus L.). Agricultural and Forest Meteorology 132: 181-200.
Müller, J., Braune H., Kahlau, A., Diepenbrock, W. (2005): Integrating leaf physiology into Virtual Plant models: a leaf-based process model that couples photosynthesis, senescence, N- Status, and C-balance. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 17: 337-338.
Müller, J., Wernecke, P., Diepenbrock, W. (2005): LEAFC3-N: a nitrogen-sensitive extension of the CO2 and H2O gas exchange model LEAFC3 parameterised and tested for winter wheat (Triticum aestivum L.). Ecological Modelling 183: 183-210.
Wiedemuth, K., Müller J., Kahlau, A., Amme, S., Mock, H-P., Grzam, A., Hell, R., Egle, K., Beschow, H., Humbeck, K. (2005): Successive maturation and senescence of individual leaves during barley whole plant ontogeny reveals temporal and spatial regulation of photosynthetic function in conjuction with C and N metabolism. Journal of Plant Physiology 162: 1226-1236.
Müller, J., Wernecke, P., Diepenbrock, W. (2002): Modelling CO2- and H2O gas exchange with respect to nitrogen state and senescence in leaves of winter wheat (Triticum aestivum L.) and winter oilseed rape (Brassica napus L.). Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 14: 290-291.
Wernecke, P., Müller, J., Diepenbrock, W. (2002): Kopplung von Struktur und Prozess: Modellierung der Lichtabsorption und der Photosynthese in dreidimensionalen Winterrapsbeständen – erste Arbeiten. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 14: 296-297.
Wernecke, P., Müller, J., Diepenbrock, W. (2001): Virtual Plants: Modelle zur Integration von Pflanzenarchitektur, Physiologie und genetischer Information. In: Gesellschaft für Pflanzenzüchtung e.V. (Hrsg.), Vortragstagung 20.-21- Juni 2001 Universität Bonn. Vorträge für Pflanzenzüchtung 52: 1-10.
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Liedecke W., Müller, J., Boczek R., Eschenröder A., Wernecke P., Diepenbrock W. (1999): A portable computer-controlled multi-chamber canopy gas exchange system. In: Donatelli M., Stockle C., Villalobos F., Villar Mir J.M. (Eds.): Proc. Int. Symp. Modelling Cropping Systems, LLeida (Spain), ESA and University of Lleida, 213-214.
Liedecke W., Müller J., Wernecke, P., Boczek R., Diepenbrock W. (1998): Modulares Großküvettensystem für Messungen des Gasaustausches im Freiland. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 11: 237-238.
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Müller, J., Wernecke, P., Liedecke, W., Diepenbrock, W. (1997): CO2- und H2O-Gasaustausch von Kulturpflanzenbeständen. Experimente und Modellierung. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 10: 283 - 284.
Wernecke P., Müller J., Diepenbrock W., 1997: Modellierung des Photonentransfers auf der Basis von virtuellen Pflanzenbeständen. Mitt. Ges. Pflanzenbauwiss. 10: 71-72.
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Müller J., Wernecke P., Claus S. (1994): Vegetation-atmosphere CO2 exchange in agro-ecosystems: I. A model of net photosynthesis rate in winter wheat canopies. In: The whole is more than the sum of the parts. Terrestrial Ecosystem Research Network of Germany - Meeting München, 21.-23.03.1994, Abstracts of key lectures and posters, GSF und TU München.
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Müller, J., Wernecke, P., Claus, S. (1993): A Model of Canopy Gas Exchange in Winter Wheat for Agro-Ecosystem Modelling I. Model Formulation. Modeling Geo-Biosphere Processes (CATENA-Verlag, Cremlingen, Germany) 2: 227-243.
Wernecke P., Müller, J., Claus, S. (1993): A model of canopy gas exchange in winter wheat for agro-ecosystem modelling. II. Experiments and model calibration. Modeling of Geo-Biosphere Processes (CATENA-Verlag, Cremlingen, Germany) 2: 245-264.
Müller, J. (1991): Zur Bestimmung der Blattfläche mittels linearer Messungen bei Weizen und Triticale (Kurzmitteilung). Archiv für Züchtungsforschung (Berlin) 21: 121-123.
Müller, J., Liedecke W., Boczek R. (1991): A computer-aided multi-channel gas exchange measurement system for leaves and intact plants. Photosynthetica 25: 241-247.
Müller, J., Brinkmann, H. (1991): Jungpflanzenwachstum von Winterweizen und Triticale bei simulierten Spätsaatbedingungen. 2. Mitt. Beziehungen zwischen Merkmalen des Jungpflanzenwachstums und Spätsaattoleranz. Archiv für Züchtungsforschung (Berlin) 21: 13-27.
Müller, J. (1990): Trockenstress und Ertragsbildung bei Winterweizen – Entwicklung, Stoffproduktion und Ertrag. Forschungsbericht Institut für Züchtungsforschung Quedlinburg, Akademie der Landwirtschaftswissenschaften, 20 S.
Müller, J., Brinkmann, H. (1990): Jungpflanzenwachstum von Winterweizen und Triticale bei simulierten Spätsaatbedingungen. 1. Mitt. Prüfverfahren. Archiv für Züchtungsforschung (Berlin) 20: 353-362.
Meinl, G., Müller, J., Moll, A. (1989): Abhängigkeit der Netto-Photosyntheserate von der Bestrahlungsstärke der photosynthetisch aktiven Strahlung bei Kopfkohl (Brassica oleracea L. var. Capitata L.). Archiv für Züchtungsforschung (Berlin) 19: 377-382.
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Müller, J. (1986): Ecophysiological characterization of CO2 exchange in leaves of winter wheat (Triticum aestivum L.) I. Model. Photosynthetica (Prague) 20: 454-465.
Müller, J. (1986): Ecophysiological characterization of CO2 exchange in leaves of winter wheat (Triticum aestivum L.) II. Analysis of irradiance and CO2 response curves by a model. Photosynthetica (Prague) 20: 466-475.
Müller, J. (1986): CO2-Gaswechsel von Winterweizen und Triticale unter Bedingungen mit variierter Wasserversorgung. Colloquia Pflanzenphysiologie (Humboldt-Universität Berlin) 10: 97-101.
Müller, J. (1984): Gaswechselphysiologische Charakterisierung von Winterweizen mit einem Modell. Wissenschaftliche Zeitschrift der Hmboldt-Universität zu Berlin, Math.-Nat. R.: 33 (4): 350-354.
Müller, J. (1984): Ein Verfahren zur Auswertung von CO2-Konzentrationsmessungen mit dem Infrarot-Gasanalysator nach der Absolut- und der Differenzmethode. Colloquia Pflanzenphysiologie (Humboldt-Universität Berlin) 7: 227-232.
Müller, J. (1982): Auswirkung von Stress auf die CO2-Aufnahmerate - Abschätzung mit einem Modell. In: Unger, K, Schuh, J. (Hrsg.): Umwelt-Stress. Wissenschaftliche Beiträge Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg Halle (Saale) 35: 212-216.
Müller, J. (1982): Analyse der ontogenetischen Veränderungen der CO2-Aufnahme von Blättern bei Winterweizen in der Kornfüllungsperiode mit einem Modell für den CO2-Gaswechsel. Colloquia Pflanzenphysiologie (Humboldt-Universität Berlin) 3: 247-249.
Müller, J. (1981): Gaswechsel-physiologische Charakterisierung von Winterweizen-Idiotypen auf der Grundlage eines Modells für den CO2-Gaswechsel von Blättern - ein Beitrag zur Entwicklung von Verfahren zur Idiotypencharakterisierung in der Züchtungsforschung. Dissertationsschrift, Institut für Züchtungsforschung Quedlinburg der Akademie der Landwirtschaftswissenschaften zu Berlin. 217 S.